Je zvyčajné, že futbalisti, predovšetkým v prvých rokoch svojej profesionálnej kariéry,  uprednostňujú slobodný život plný párty a osláv, namiesto usporiadaného rodinného štýlu. Wayne Rooney je v tomto ohľade iný. Svoju súčasnú manželku Coleen spoznal už na strednej škole, na liverpoolskom predmestí Croxteth. Pár spolu začal chodiť v 16 rokoch, k svadbe však došlo až v roku 2008. Rooneyovci spolu majú dvoch synov – Kaia a Klaya. Manželia prekonali nejednu krízu, pričom ich vzťahové problémy boli o to náročnejšie, že ich rozoberalo celé Anglicko na stránkach bulvárnych plátkov.