K futbalu sa dostal ako štvorročný. Jeho prvým klubom v kariére bol miestny celok Jupie Podlavice, kde napokon zotrval takmer 10 rokov. Úspechy zožal azda v každej jednej futbalovej kategórii a meno Hamšík začalo rezonovať vo futbalových kuloároch s pribúdajúcim vekom mladého futbalistu stále viac a viac.