Ako mladý začínajúci futbalista pôsobil v Bayerne Mníchov. Cez všetky vekové kategórie v mládežníckom futbale až po B tím Die Roten prešiel Mats Hummels až do prvého tímu, avšak tu sa jeho posun zastal. V Bayerne za dva roky nastúpil na jediný ligový zápas a v klube mu dali najavo, že s ním nepočítajú. Hummels teda zvolil prestup k veľkému rivalovi Bayernu, Borussii Dortmund, kde sa za 8 rokov stal klubovou ikonou. Avšak Hummels pocítil volanie domova a toto leto sa rozhodol prestúpiť do Bayernu Mníchov, hoci sa jeho rozhodnutie nestretlo medzi fanúšikmi BVB s pochopením. Hummels má momentálne 27 rokov, patrí medzi najväčšie stopérske osobnosti v súčasnom futbale a skúsi to tam, kde mu ako mladíkovi povedali, že ho nechcú.