V lete 2013 zaň Manchester City zaplatil 40 miliónov eur a brazílsky stredopoliar sa vypracoval medzi najlepších vo svojom odbore. Fernandinho odohral za „The Sky Blues“ už viac než 150 zápasov a patrí k najhlavnejším oporám klubu. Zmluva však končí brazílskej 31-ročnej hviezde už v júni a zatiaľ to na jej predĺženie nevyzerá, čo dáva nádej ostatným klubom, ktoré majú o tohto záložníka záujem.