V lete 2018 sa stal náhradou za Thibauta Courtoisa a zároveň najdrahším brankárom všetkých čias. 80-miliónová akvizícia londýnskej Chelsea tak dostala do rúk veľkú zodpovednosť a zároveň istotu herného času, čo určite zapracovalo aj na zvýšení hráčovho ega. I keď doteraz bolo všetko v poriadku, španielsky brankár sa vyfarbil vo finále ligového pohára proti Manchestru City, kde odmietol vystriedať skúseného matadora Willyho Caballera, ktorého plánoval Maurzio Sarri vyslať na penaltový rozstrel. Kauza napokon skončila pokutou vo výške týždenného platu (140 000 eur) a Kepa taktiež neodchytal ďalší zápas, kde CFC napokon porazili Tottenham 2:0.