V sezóne 1999/2000 vyhral Inter Bratislava svoje prvé double, ale na začiatku tejto sezóny sa v Pohári UEFA moc nevyznamenal, teda lepšie povedané, v jeho 2.kole. Veď predtým žlto-čierni vyradili dvoch súperov, pričom Rapid Viedeň porazili v oboch zápasoch, lenže dovtedajšie sympatické vystúpenie si úplne pokazili proti francúzskemu Nantes. V prvom zápase na Pasienkoch dostali trojku, keď sa tréner Bubenko sťažoval na chybu súčasného trénera Trenčína Ševelu, ktorého dal v polčase dole. Ale ani toto Interu nepomohlo, vonku dostal štvorku a celkovo tak prehral 7:0.