Tým, ktorí pravidelne sledujú zápolenie dvoch madridských rivalov, Atlética a Realu, určite ako prvé napadnú časté slovné potýčky, ktoré Juanfran Torres vedie so súpermi v drese Realu Madrid. Avšak on sám v bielom drese začínal, už v mládežníckej akadémii Merengues. Dve sezóny neskôr strávil v B tíme, aby v rokoch 2004-2006 prenikol aj do prvého tímu. Avšak popri hviezdnych hráčoch Realu mu ruže nekvitli, a tak absolvoval len šesť ligových zápasov za svoj materský klub. Potom prišlo hosťovanie v Espanyole a prestup do Osasuny, kde strávil päť rokov a odohral 148 ligových zápasov. V roku 2011 prišiel prestup k mestskému rivalovi Realu, Atléticu, kde sa vypracoval na jedného z najlepších pravých obrancov súčasnosti. O to sladšie sú tohtosezónne víťazstva Atlética nad bývalým klubom, v ktorom nedostal šancu.