Počas MS 2010 sa Rooneyho jeden novinár spýtal na ruženec, ktorý mal zavesený na krku počas jedného z tréningov. Rooney odpovedal: „To je moje náboženstvo.“ Potom zasiahol jeden z funkcionárov anglického tímu, ktorý zastavil diskusiu so slovami „Tu náboženstvo nevedieme.“ Neskôr Wayne priznal, že chodil do katolíckej školy, vedenej rádovými sestrami, kde sa naučil pravidelnej modlitbe. Daniel Sturridge raz vyhlásil, že pre Rooneyho nie je jednoduché vyjadrovať svoju vieru, preto asi často Rooneyho neuvidíte s kresťanskými odkazmi či posolstvami.