Zápolenie mnohých klubov o zisk talentovaného mladíka vyhral taliansky Neapol, ktorý za služby slovenského reprezentanta zaplatil sumu vo výške 5 miliónov eur. Prezident Neapolu Aurelia de Laurentiss vtedy neskrýval radosť zo zisku slovenského hráča: „Hamšík je prísľubom do budúcnosti. Raz z neho môže byť hviezda svetového futbalu.“

Samotný hráč sa zo záujmu talianskeho klubu rovnako tešil: „Bolo by fantastické nastúpiť v tíme, ktorý preslávil Diego Maradona. Ak môj prestup do Neapola vyjde, budem veľmi šťastný.“ 

Po príchode do Neapolu sa okamžite zaradil medzi opory mužstva a postupom času sa zaradil medzi najlepších futbalistov ligy. Postupom času sa z Mareka Hamšíka stal minimálne v Taliansku futbalový fenomén. Ešte v roku 2008 bol vyhlásený za najlepšieho mladého hráča sezóny a o niekoľko rokov na to začal napĺňať potenciál. Vo veku 22 rokov a 229 dní sa v roku 2010 stal najmladším kapitánom v histórii Neapolu, o dva roky na to, bol renomovaným denníkom La Gazzetta dello Sport zaradený medzi piatich najlepších futbalistov Serie A a v tej istej sezóne bol zaradený do najlepšej jedenástky roka.