Marek Hamšík debutoval v tíme Brescie v Serii A vo veku 17 rokov a 237 dní. Jeho tímu sa ale v elitnej lige nedarilo a vypadol do Serie B, kde sa ale Hamšík zaradil medzi hviezdy svojho klubu, v sezóne 2006/2007 strelil v 40 zápasoch 10 gólov a každému bolo nad slnko jasné, že si ho Brescia v tíme neudrží.