Ide o podobný prípad ako pri jeho stopérskom kolegovi z národného dresu Jánovi Ďuricovi. Dobre síce začal v Marseille aj Tomáš Hubočan, ale následne tiež pomerne rýchlo o miesto v základnej zostave prišiel. Škrtel je jasnou oporou Fenerbahce Istanbul, ktorú nezastaví ani zlomený nos. Jeho výkony určite nie sú problémom pre defenzívu Istanbulčanov, skôr naopak, fanúšikovia by privítali, aby každý obranca hral ako Škrtel. A hoci ten hrá dobre a pravidelne, Fenerbahce sezóna zatiaľ nevychádza, keď mu ušla Liga majstrov a v tureckej lige je iba v strede tabuľky.