V druhom predkole Pohára UEFA 2006/07 hrali hneď tri izraelské celky. Postup ďalej si dokázal zabezpečiť len jeden a neostal len pri predkolách. Dvojzápas so slovinským NK Domžale nemôžeme označiť za jednoduchý, ale najdôležitejší bol postupový výsledok. V prvom kole hlavnej súťaže hrala Haifa s bulharským Litexom Loveč a miestenku v skupinách si zabezpečila po výsledkoch 1:1 a 3:1. Keď žreb odhalil Izraelčanom súperov ako Glasgow Rangers, Livorno, Auxerre a Partizan Belehrad, oslavy sa nechystali. „Zelení“ sa ale nechystali hrať druhé husle a od samého úvodu prekvapovali. Začalo to domácim zdolaním francúzskeho Auxerre 3:1. Rangers ale tomuto súperovi nepustili ani bod. Maccabi pokračovali v pomerne kolísavých výkonoch, ale z času na čas sa im podarilo ukoristiť body. Zdolali Partizan a jeden bod získali aj v Livorne. V posledný hrací deň mal outsider voľno a po štyroch odohraných zápasoch musel čakať na to, ako si budú počínať konkurenti. Postup ďalej však bol viac ako pravdepodobný. Rangers zdolali Partizan a Livorno vyhralo na trávniku Auxerre. To boli okolnosti, za ktorých Škóti obsadili prvé miesto, Izraelčania druhé a postúpilo aj talianske Livorno. Zástupca francúzskej ligy musel dlho predychávať, kto ho pripravil o postup ďalej. Mužstvo, ktoré hralo domáce zápasy v Tel Avive, v Európskej lige pokračovalo. Prekvapujúco síce nebolo jediným tímom izraelskej Premier League, ale šestnásťfinále stále nebolo konečnou stanicou. Maccabi zohrali náročný dvojzápas s CSKA Moskva. V Rusku sa boj skončil bezgólovou remízou, no doma rozhodol jediný gól. Haifania sa prebili medzi kluby ako Newcastle, Tottenham, AZ Alkmaar, Leverkusen, Benfica a ich súperom bol barcelonský Espanyol. Aj v tomto prípade sa prvý zápas skončil remízou 0:0, ale na izraelskej pôde. V Španielsku už Barcelončania svoju úlohu zvládli a outsiderovi dali ráznu stopku v podobe porážky 0:4. I tak je to na dlhé roky najlepší výsledok nielen pre Maccabi Haifu, ale aj pre celý národný futbal.